高等教育系统的协调是指高等教育系统内各高等学校之间的协调，这既是现代高等教育实践中的量要问题，也是当今高等教育理论研究的重要课题。高等教育系统协调的机制主要有三个：管理、竞争和合作。管理是对高等教育系统的强制性协调；竞争是高等学校之间的自发性协调；合作是高等学校之间的自觉性协调。三种机制在整个高等教育系统协调中的作用是互补的。